Para facilitar la coordinación de las actividades, los procesos de gestión y tener una mejor estructura, la Red-POP está constituida por los siguientes nodos:

• Nodo Sur (Argentina, Brasil, Chile, Paraguay y Uruguay)
• Nodo Andes (Bolivia, Colombia, Ecuador, Perú y Venezuela)
• Nodo Norte y Caribe (Belice, Costa Rica, El Salvador, Guatemala, Honduras, Nicaragua, México, Panamá, Cuba, Jamaica, Puerto Rico, República Dominicana, Trinidad y Tobago, demás países del área).

La coordinación de la Red está a cargo de una Dirección Ejecutiva, constituida por un Directora Ejecutiva y de un Consejo Coordinador constituido este último por los Coordinadores de Nodos.

Desde el 1º de enero de 2006 y por un período de dos años, el Consejo Coordinador está compuesto por:

Directora Ejecutiva: Dra. Haydée Domic, Museo MIM y Programa Explora de Chile.

Coordinadora Nodo Sur: Prof. Nelsa Bottinelli, Asociación Civil Ciencia Viva, Uruguay.
Ver el Resumen del informe de actividades 2006

Coordinador Nodo Andes: Dr. Julián Bentancourt, Museo de la Ciencia y el Juego, Colombia.

Coordinadora Nodo Norte y Caribe: María del Carmen Farías, Fondo de Cultura Económica, México.